◇ 1.N-和O-糖基化位点和糖型全面解析；
完整糖肽蛋白组学技术凭借其强大的分析能力，仅需一次实验，便能全方位解析糖链、修饰位点、修饰肽段及修饰蛋白，实现N-和O-糖基化研究的多维度分析，为深入探究蛋白糖基化的复杂机制提供了有力支持。

◇ 2.独特的糖肽富集方法，确保糖肽的高效富集与深度鉴定；
糖肽富集技术是糖蛋白质组学研究中的关键环节，它能够从复杂的生物样品中分离和富集糖肽，为后续的质谱分析提供高质量的样本。百蓁生物开发了独特的糖肽富集方法流程，实现糖肽的深度检测与高效富集。

◇ 3.独有结构分辨的糖基化解析软件确保鉴定和定量准确性；
数据解析采用特有的PEAKS^® GlycanFinder分析软件，软件集成了肽段和聚糖二者兼顾的搜索策略，算法不仅通过肽段的二级碎片离子匹配肽段序列以确证修饰位点，还要求匹配糖链特有的结构碎片离子以确证糖型，这种“双重证据链”极大提升了位点和糖型鉴定的可信度。软件也支持完整糖肽和糖蛋白的可靠定量，基于不同样本中肽段特征峰的相对丰度进行定量，并通过Match Between Runs对不同样本中同一肽段的特征峰进行匹配。

本研究对124份临床血清样本（乳腺癌患者、良性病变患者及对照组）进行糖蛋白组分析，研究方法通过优化质谱分析方法和机器学习算法，从乳腺癌的临床样本中鉴定和定量位点特异性的糖基化特征，最终确定了15种位点特异性聚糖作为检测乳腺癌症的潜在生物标记。这种方法不仅为乳腺癌的早期诊断提供了新的生物标志物，也为其他疾病的糖蛋白组学研究提供了新的思路和工具。

本研究通过蛋白质组学和N-糖蛋白质组学分析，比较了类风湿关节炎（RA）和骨关节炎（OA）患者滑膜组织的蛋白质和N-糖基化差异。研究发现RA滑膜中存在76种差异表达的完整N-糖肽，其中67种在RA中上调。这些差异糖肽主要涉及免疫反应，且与免疫细胞浸润相关。此外，RA滑膜中糖基化酶表达增加，可能与异常糖基化有关，研究为理解RA的发病机制提供了新的见解。

本研究通过整合蛋白质组学和精确N-糖蛋白质组学方法，研究了小鼠腹膜巨噬细胞在LPS、HSV和VSV不同刺激下的蛋白质和糖蛋白变化。研究发现，巨噬细胞中的糖蛋白在多种重要生物过程中广泛参与，如抗原呈递、细胞因子产生和糖基化进程。在不同病原体刺激下，糖蛋白表达显著变化，特别是Toll样受体通路中的受体（如Tlr2和CD14）在LPS和HSV刺激下增加。此外，研究还证实糖基化影响这些蛋白的亚细胞定位和功能。