来源：百蓁生物发布时间：2025-05-21浏览量：12次
DIA免疫肽组学则是结合了DIA技术与免疫肽组学研究的领域，主要研究细胞在抗原呈递过程中，由MHC I类和II类分子呈递的全部多肽。DIA技术在免疫肽组学中的应用，能够无遗漏地采集样本中所有离子的碎片信息，从而实现对MHC呈递肽段的全面、高灵敏度检测。这种方法特别适用于比较或差异免疫肽组学研究，能够提高肽段的重现性和定量准确性。
图1. DDA和DIA数据采集原理示意图（DOI: 10.1002/mas.21709）
一、DIA 免疫肽组
为了实现免疫肽的高覆盖和精准定量，百蓁生物推出DIA 免疫肽组服务，该服务优势有：
相比于DDA方法，DIA方法鉴定到的免疫肽数量提升了7%，特别是对于低起始量的样本，免疫肽鉴定数量提升比例更加明显。这表明DIA模式在肽段检测中具有更高的灵敏度和覆盖度，能够鉴定出更多的肽段。
图2. DDA和DIA方法下免疫肽鉴定结果
DIA方法鉴定到肽段在2个样本中重叠比例（74.5%）明显高于DDA方法（55.6%），且每个样本中鉴定到独特的肽段较少，这表明DIA这种全面的扫描方式表现出更高的稳定性和可靠性。
图3. DDA和DIA方法下免疫肽鉴定的稳定性
在定量方面，DDA 模式下可定量的肽段比例是73%，而DIA基本上可以达到100%肽段的定量。定量的准确性方面，DIA方法下肽段定量值的变异系数（CV）小于20%的占比可以达到94%，而DDA方法下CV小于20%占比为81%。这表明DIA方法与DDA方法相比，肽段的可定量性和精确性都表现更优。
图4. DDA和DIA模式下定量的结果
二、DDA和DIA免疫肽组的选择
DDA方法谱图复杂度低，DeepNovo®解析肽段的精准度更高，因此在新抗原发现或鉴定方面建议选择DDA模式。在免疫肽鉴定或定量方面且对DeepNovo®没有要求的可以选择DIA模式，表1是基于不同的研究目的汇总的DDA和DIA方法选择建议。
表1. 不同研究目的DDA和DIA的选择
此外，对于目标抗原鉴定和定量，如通过TMG（Tandem Minigene）技术或过表达的方式转染到某个特定的HLA细胞系进行检测，建议选择DIA模式。如图5所示，研究人员在过表达的HLA-A*11:01细胞系中转染了一个包含47种常见癌症突变的新抗原肽段，DIA的方法在不同样本量梯度下提供了更完整的覆盖和定量的重复性，并在低至100万个细胞情况下可以检测14种新抗原，而DDA的方法只能检测到4种新抗原。
图5. 不同样本量目标抗原检测的结果（DOI: 10.1016/j.mcpro.2025.100938）
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